Les archives apportent une information précise sur les travaux scientifiques d'André Chevallier, au travers de la liste exhaustive de ses publications et de la conservation de nombreux manuscrits. Elles fournissent des informations nouvelles tant pour l'histoire des sciences de la nutrition et de la cancérologie, que pour celle des techniques de biophysique et l'usage des rayonnements (rayons X, radio-isotopes) pour le diagnostic et la thérapeutique.

Une production scientifique très riche
De 1919 à 1964, André Chevallier publie environ 260 articles, dépose six brevets et écrit un livre sur le cancer publié aux Presses Universitaires de France (traduit en italien). Comme c'est l'usage à l'époque, pour l'essentiel, ces travaux paraissent dans des Comptes Rendus (de l'Académie des Sciences, de la Société de Biologie), ainsi que dans des Annales (de nutrition et d'alimentation, de nutrition, de physiologie, de neurologie, de radiologie, de cancer). En tant que biophysicien, il publie dans des revues de sociétés spécialisées : de chimie, de physique, de chimie biologique, d'électricité, d'optique.
En tant que médecin, il publie dans de très nombreux journaux médicaux : les Comptes Rendus de l'Académie de Médecine, les Comptes Rendus de l'Académie de Chirurgie,les Comptes Rendus de la Société scientifique d'hygiène alimentaire, le Journal de Radiologie et d'Électrologie, la Semaine des Hôpitaux, l'Encyclopédie médico-chirurgicale, le Journal de Médecine de Lyon, le Journal de la Société médicale des Hôpitaux de Paris, Strasbourg médical...
La majorité de ses publications sont en français. Sa première publication en anglais (et l'une des rares), paraît dans Biochemical Journal, en 1933, sur le dosage de la vitamine A par la méthode spectro-photométrique, qu'il a mise sur pied avec Pierre Dubouloz. Il a publié également en italien et en allemand.

Ses recherches à Lyon
Avant guerre, à Lyon, ses recherches concernent :
- la radiobiologie et la cancérologie : les rayons X et les effets secondaires ; le radium, le thorium et leurs effets biologiques (dont l'effet sur l'excitabilité neuromusculaire) et thérapeutiques (dans les leucémies) ;
- l'électrophysiologie : les courants à hautes fréquences et l'excitabilité des nerfs ;
- la biophysique : les colloïdes et leurs propriétés (dont les propriétés magnéto-optiques), la viscosité appliquée aux liquides biologiques, la physico-chimie du sérum sanguin (et ses propriétés optiques), les tensions superficielles entre liquides.
Il s'intéresse également à la vitamine A et au lait, sujet qu'il poursuit pendant et après la guerre, en étudiant notamment le lait de femme.

Sa production à Marseille
A Marseille, il publie, en 1931, avec Pierre Dubouloz sur la fluorescence et les mesures photométriques dans les ultraviolets et, en 1932, sur la mise au point d'une technique nouvelle de spectrométrie dans l'ultraviolet. Cet appareil devait être exposé pour représenter la France à l'Exposition universelle de 1939. Grâce à cette méthode révolutionnaire, il peut développer un champ nouveau de recherches sur la vitamine A, les huiles et les hormones stéroïdiennes. Il s'intéresse d'abord au dosage de la vitamine A, son métabolisme (dans le foie et le sang, notamment), sa dégradation (rayonnements du thorium, photochimie), sa fonction physiologique, ses effets nutritionnels, mais aussi la cicatrisation, ses carences et son rôle dans les hépatites. Il conduit une recherche tout à fait originale sur la vision nocturne, en prenant comme sujets témoins les militaires du croiseur Le Duquesne (comme en atteste sa correspondance avec le médecin militaire).
Pendant la guerre, il poursuit ses recherches sur les vitamines et développe les enquêtes sur la nutrition de la population, tout d'abord avec la Fondation Rockefeller, puis à l'Institut national d'hygiène (INH). Ces publications font l'objet de communications à l'INH et de publications dont celle qu'il co-signera avec les nutritionnistes J.-B. Youmans et D. Kuhlmann en 1941.

Ses activités scientifiques après-guerre à Strasbourg
Dès son arrivée à Strasbourg, il reprend ses activités scientifiques avec Simone Manuel, Pierre Denoix, Constant Burg, et aborde de nouvelles problématiques sur la cancérogenèse : carbures cancérigènes, pouvoir anti-oxygène des graisses, oxydation des lipides, mesures des lipides, influence de certaines hormones et vitamines liposolubles... Il publie plus tard sur la cancérisation par le benzopyrène.
En 1951, il crée un laboratoire sur les radio-isotopes et s'intéresse notamment à l'influence des radio-phosphates sur l'activité des lipides des tissus animaux. Il poursuit ses recherches sur les rayons X et sur les conséquences des traitements à base d'agents physiques. Il développe une nouvelle thérapeutique à partir du radio-phosphate de chrome colloïdal, méthode qui sera utilisée dans le traitement de plusieurs types de cancers (vessie, sein, rectum, bronches, métastases lymphatiques, leucoses). Il introduit également la cobaltothérapie et publie sur la gamma-encéphalographie, les traitements localisés et leurs effets, les associations de traitements. Il ne cesse de s'intéresser aux questions nutritionnelles, au travers des questions de contamination de la chaîne alimentaire. Il coopére avec le CEA pour mesurer la contamination radio-active de l'environnement par les centrales nucléaires ou consécutive aux essais nucléaires soviétiques ! Sa dernière publication, présentée à un colloque franco-soviétique à Paris en juin 1964, portera sur l'association de la chimiothérapie et de la radiothérapie.